柔性防水套管的填充工程常常发生套管堵塞的问题，出现问题的原因基本都是以下几点：
     现浇楼板、柱内的穿梁柔性防水套管在配合土建安装完成之后，浇捣混凝土之前应采用报纸、草包等软性物填充严密，防止沙浆进入套管和接线盒引起堵塞。
     为防止室外地下水或雨水通过柔性防水套管进入地下室，可以确保后续设备安装有良好的施工环境。因此，地下室出外墙处柔性防水套管除采用软性物封堵外，在柔性防水套管预制加工时，应在套管一端端口采用钢板焊接封堵，待柔性防水套管管道安装时再开启。
     管道穿防水外墙，应随结构预埋刚性或柔性柔性防水套管。
     管道穿墙处、穿楼板处、穿屋面处应随结构预留洞，待结构施工完毕后再进行套管埋设，穿墙预留套管时两端一定要用胶布等密封好。
越人防楼板、人防墙体及人防扩散室处的管道及测压管应随结构预埋密闭套管。
     不管是柔性防水套管还是刚性防水套管,最主要的填充材料都是混凝土，柔性防水套管穿墙时，一般与墙壁相平不需要伸出,这是因为柔性防水套管的内部已经有好的密封结构,而刚性的却没有。柔性防水套管是预先埋置在混凝土内的，钻孔后再进行放置等于摆设。穿管安装完成后，管道与套管间隙填塞柔性防水材料。